Nid yw metel molybdenwm yn bodoli yn ei gyflwr rhydd o ran natur. Prif fwyn molybdenwm yw molybdenit (disulfide molybdenwm, MoS₂).
Mae cronfeydd wrth gefn molybdenwm ar y ddaear yn fach, dim ond 0.001% o bwysau cramen y ddaear yw ei gynnwys, ac mae cyfanswm y cronfeydd wrth gefn o fwyn molybdenwm tua 15 miliwn o dunelli, wedi'u dosbarthu'n bennaf yn yr Unol Daleithiau, Tsieina, Chile, Rwsia, Canada a gwledydd eraill. Mae cronfeydd metel molybdenwm profedig Tsieina yn 1.72 miliwn o dunelli, ac mae'r cronfeydd wrth gefn sylfaenol yn 3.43 miliwn o dunelli, gan ddod yn ail yn y byd ar ôl yr Unol Daleithiau. Mae mwyn molybdenwm wedi'i grynhoi mewn pedair talaith: Shaanxi, Henan, Jilin a Liaoning.